进入明治时代之后，文明开化的浪潮势不可挡，不过日本仍有许多迷信、轶闻、奇谈流传各地…以科学的角度研究并且否定妖怪，最后被世人称为妖怪博士的哲学家‧东日流六平太，他与真心相信妖怪存在的助手‧泊赖武携手合...

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进入明治时代之后，文明开化的浪潮势不可挡，不过日本仍有许多迷信、轶闻、奇谈流传各地…以科学的角度研究并且否定妖怪，最后被世人称为妖怪博士的哲学家‧东日流六平太，他与真心相信妖怪存在的助手‧泊赖武携手合作，为了破除迷信，前往挑战各地发生的超自然现象!!哲学家‧东日流六平太与助手‧泊赖武两人为了破除日本各地的妖怪迷信而一起踏上旅程。他们遇上身高比自己更矮就会杀人的见越入道，可看透一切事物的千里眼姑娘，还有死了也会继续战斗的武将亡灵，以及守护山林与山上居民的古神…前往打探这些传说的两人，究竟会有什么遭遇呢…!?哲学家‧东日流六平太与助手‧泊赖武两人为了破除妖怪迷信，一起在日本各地旅行。他们遇上可以操纵并且杀害他人，进而收集灵魂的妖怪‧幽谷响，以及相传会让人生下死胎的妖怪‧产女…想要杀死武的眉轮出现在挑战妖怪传说的两人面前!?明治妖怪奇谭终于完结!!